Esse monte de objeto que você apagou, não existem mais?
Tem algum motivo para isso?

Paulista, você removeu vários objetos do mapa, além de colocar lugares que não existem (pokéstops).
Por favor, tenha mais cuidado ao modificar os objetos e também para não inserir locais fictícios.

Marcos, os trechos de rodovia que passam dentro da cidade geralmente devem continuar tendo a mesma classificação.
Por exemplo, o caminho da SE-175 que se interliga com a SE-240 devem possuir uma hierarquia sem "quebras" (mantendo-se como primárias, nesse caso)

Felipe, não é correto criar proibições de retorno para a própria rua, principalmente quando ela é de mão única (isso já implica que não é possível trafegar na outra direção).

Cristiano, essa nomenclatura de "draft", "<Trevo>", etc, é de algum lugar?

Marcio, essa distorção entre o que existe traçado e a imagem de satélite é causada pela própria imagem do Bing.
Em toda atualização do Bing sempre é introduzido algum tipo de deslocamento ou distorção das imagens (fazendo com que os dados pareçam incorretos).
Geralmente é melhor não realinhar quando houver deslocamentos dessa forma.

I guess that the picnic table isn't named "Pokemon Gym", right? :-)

Gabriel, a mesma coisa aqui (e para qualquer outro tipo de objeto): nomes descritivos ou genéricos não devem ser utilizados
Se a estrada não possui nome ou se não sabe o nome dela, basta deixar sem nome
Colocar "Estrada" apenas não é correto

Gabriel, você está duplicando muitas coisas no mapa.
Vários bairros você está colocando com mais de 1 ponto representando o local.
Só precisa de apenas um ponto para definir o bairro.

Gabriel, nomes genéricos ou descritivos não devem ser utilizados no mapa.
Por exemplo, não precisa falar que um semáforo tem o nome de "Semáforo"

Luís, ao traçar as áreas, tente desenhá-las apenas onde elas realmente se encontram, sem grudar nenhum ponto com as ruas ao redor.

Sem problemas.
Se você tiver interesse em participar da comunidade, tirar alguma dúvida ou conversar sobre algo, a gente tem vários meios de comunicação

Dá uma olhada em osm.wiki/Pt:Contact

Tem lista de e-mail, fórum de discussão, grupo no Telegram, etc
Abraço!

Mas a estrada passa exatamente onde existia a linha de trem?
O problema que você está vendo é que no iD ele acaba grudando o caminho que você está traçando (de uma rua, por exemplo) com a linha antiga do trem?

Blademir, Cotia osm.org/relation/5249875 é bairro ou distrito?

Renildo, você criou alguns pequenos trechos representados como "túnel" onde algumas ruas passava debaixo de um viaduto.
Note que não é necessário (e nem correto) esse tipo de representação, já que o trecho não é um túnel.
Em geral, se houver um viaduto passando pelo trecho da rua, não há a necessidade de se mapear esse trecho abaixo como túnel.

Anderson, você criou vários objetos duplicando informações que já existiam no mapa, vários inclusive no mesmo local (e cada um com uma classificação)

C210, você criou pequenos trechos de túnel passando por debaixo do viaduto. Isso não é correto de se fazer.
Já existe um viaduto no local (que já representa os caminhos que não se cruzam).
Um "túnel" deve ser utilizado realmente quando existe um túnel e não quando um caminho passa debaixo de uma ponte ou viaduto.

The proper fix here was to remove the "tunnel" key, instead adding a "layer = -1"

AjBelnuovo, você está reclassificando muitas rodovias de forma errada.
Por exemplo, muitas vias sem pavimentação, que deveriam ser no máximo terciárias, você está deixando todas como secundárias.

kid5, não grude as áreas nas ruas.
Isso não é correto de se fazer e gera transtornos para quem for editar futuramente.